Cán bộ công chức, viên chức bị ảnh hưởng bởi sắp xếp đơn vị hành chính được giữ nguyên chế độ tiền lương và phụ cấp chức vụ 6 tháng. Sau 6 tháng, chế độ sẽ theo quy định pháp luật. Điều chuyển công tác đến vùng khó khăn được hưởng phụ cấp theo Nghị định 76.
Cán bộ, công chức cấp xã nghỉ hưu trước tuổi và được bầu làm bí thư chi bộ không phải hoàn trả trợ cấp đã nhận. Khi tính lương theo Nghị định 178, phụ cấp ưu đãi theo nghề được tính vào tiền lương tháng hiện hưởng. Công chức chuyển về xã đặc biệt khó khăn tiếp tục hưởng chế độ, chính sách như trước khi sắp xếp đơn vị hành chính.
UBND Thành phố Hà Nội yêu cầu các cơ quan, đơn vị thực hiện nhiệm vụ về quản lý nhà nước trật tự xã hội trong sắp xếp đơn vị hành chính. Việc này nhằm đảm bảo hoạt động của các cơ quan, tổ chức không bị gián đoạn.